蕨类植物有了根、茎、叶的分化，而且根、茎、叶中有输导组织，能为植株输送营养物质，一般长的比较高大，靠孢子繁殖后代，属于孢子植物。

A．苔藓植物生活在阴湿的环境中，没有真正的根，虽然有了茎和叶，但茎、叶内无输导组织，不能为植株输送大量的营养物质供其利用，所以苔藓植物比较矮小。蕨类植物也生活在阴湿的环境中，有了根、茎、叶的分化，根能吸收大量的水和无机盐，并且体内有输导组织，能为植株输送大量的营养物质供植物生长利用，因此蕨类植物一般长的比较高大。故A正确。

B．蕨类植物也生活在阴湿的环境中，有了根、茎、叶的分化，根能吸收大量的水和无机盐，并且根、茎、叶中都有输导组织，故B正确；

C．桫椤是现存唯一的木本蕨类植物，极其珍贵，堪称国宝，桫椤的叶片背面有孢子囊，不是种子囊，故C错误。

D．古代的蕨类植物被埋藏在地层中，经过漫长的年代，经过复杂的变化，变成了煤炭，故D正确。